Une chapelle du XVe siècle au milieu du bocage
Le nom de Quilly viendrait du breton Killi, le bocage ou le bosquet. À l'écart du bourg, la chapelle Notre-Dame de Planté est attestée au moins dès 1468 ; sa restauration extérieure, menée avec des techniques traditionnelles, s'est achevée en 2012. Le site qui l'entoure est classé en zone naturelle d'intérêt écologique, faunistique et floristique de type 1, avec une aire de pique-nique, et deux circuits de randonnée de 9 et 11 kilomètres, tracés par l'association de l'Estuaire au Sillon, y conduisent.
Dans le bourg, l'église paroissiale date de 1845. Au XVIIIe siècle, le moulin de Quilly appartenait à la famille du Cambout de Coislin, celle du château de Carheil à Plessé. Les ruisseaux de la Basse Ville et du Moulin à Foulon traversent la commune, membre de la communauté de communes Estuaire et Sillon. First Incendie intervient à Quilly auprès des lieux qui reçoivent du public, des artisans et des entreprises.